Xanh methylene đã được miêu tả là "loại thuốc tổng hợp đầu tiên được sử dụng trong y học". Xanh methylene được điều chế vào năm 1876 bởi nhà hóa học người Đức Heinrich Caro.[36]

Sử dụng nó trong điều trị sốt rét do Paul Guttmann và Paul Ehrlich tiến hành vào năm 1891. Trong giai đoạn này trước Thế chiến thứ nhất, các nhà nghiên cứu như Ehrlich tin rằng thuốc và thuốc nhuộm hoạt động theo cùng một cách, bằng cách ưu tiên làm sạch mầm bệnh và có thể gây hại cho chúng. Xanh methylene tiếp tục được sử dụng trong Thế chiến thứ hai, nơi nó không được ưa thích bởi những người lính, những người quan sát, "Ngay cả ở loo, chúng ta thấy, chúng ta đi tiểu, màu xanh hải quân." Việc sử dụng thuốc chống sốt rét gần đây đã được hồi sinh.[37] Nó đã được phát hiện là một thuốc giải độc cho ngộ độc carbon monoxide và ngộ độc xyanua vào năm 1933 bởi Matilda Brooks.[38]

Nước tiểu màu xanh được sử dụng để theo dõi sự tuân thủ của các bệnh nhân tâm thần với chế độ thuốc men. Điều này dẫn đến sự quan tâm - từ những năm 1890 cho đến ngày nay - trong thuốc chống trầm cảm và các hiệu ứng thần kinh khác. Nó trở thành hợp chất chì trong nghiên cứu dẫn đến việc phát hiện chlorpromazine.